Ved et tilfælde opdager Forsvarets Efterretningstjeneste, at parret formentlig stadig er i live og i stedet er blevet kidnappet af Al Qaida og terrorbevægelsens somaliske allierede, Al Shabaab, som opbevarer far og datter på et ukendt sted i Somalia. Professoren tvinges til at fremstille en bioterrorbombe indeholdende en dødelig virus, der skal udløses i en europæisk storby. Tusinder af menneske liv er i fare, og panikken breder sig i de danske og udenlandske efterretningstjenester. Jægersoldaten Michael Plessner bringes i førersædet, og hans opgave er klar: Med sit team af håndplukkede jægersoldater skal han befri de danske gidsler og forhindre, at Al Qaida og Al Shabaab udfører den planlagte terroraktion. I et hæsblæsende kapløb med tiden infiltrerer Michael Plessner og hansmænd i al hemmelighed dybt ind i Somalia ved hjælp af en lokal milits,og endnu engang står Plessner overfor sin arvefjende, Al Qaidatopterroristen Mohammed Jamal Azzam.Samtidig afsløres de to forsvundne danskeres skæbner. Den ene viser sigat have en højst overraskende rolle i et kynisk og kalkuleret komplot. Sort Daggry er andet bind i Thomas Rathsacks thrillerserie om jægersoldaten Michael Plessner.
